Museum Sophiahof wordt bestuurd door de Stichting beheer Sophiahof, bestaande uit Sandra Mulder (voorzitter) , Marlon Sahetapy (penningmeester) en Erwin Sjoerdsma.

Samen met directeur-beheerder Reinier van Ooijen zijn zij verantwoordelijk voor het beheer, onderhoud en instandhouding van Museum Sophiahof.

De stichting heeft ook een Raad van Toezicht bestaande uit: voorzitter Harriet Ferdinandus, vicevoorzitter John Sijmonsbergen, Jim van der Meer Mohr, Kaja Sariwating en Silfraire Delhaye.

V.l.n.r. Erwin Sjoerdsma, Reinier van Ooijen, Marlon Sahetapy en Sandra Mulder.